2025 Movement Disorders Жылдын мыкты макаласына сын-пикир
Узак окуу секвенирлөөсүн жана оптикалык геномду картага түшүрүү технологияларын колдонуу менен нейродегенеративдик ооруларды изилдөө 

---

Tweet

Биз "2025-жылдын мыкты макаласы" наамын алганыбызга кубанычтабыз Movement Disorders журнал. Тапшыргандан кийин Movement Disorders PRKN менен байланышкан Паркинсон оорусу (ПО) менен шайкеш келген фенотипи бар эки бир тууганды узак окуу секвенирлөө (LRS) жолу менен чечкенин сүрөттөгөн макалада башкы редактор бизди генетик эмес аудитория үчүн жаңы технологияларга басым жасаган сын-пикир жазууга чакырды.

Бул сереп эки себептен улам өз убагында жазылган деп эсептедик. Биринчиден, нейродегенеративдик оорулар контекстинде LRSти колдонгондордун саны көбөйүп, адабияттардан алынган далилдер анын бүтүндөй экзом же бүтүндөй геномду кыска окуу ырааттуулугу менен түшүндүрүлбөгөн учурларды чечүү жөндөмүн далилдеди. Экинчиден, эң акыркы сереп 2021-жылы Су жана башкалар тарабынан Неврология боюнча жарыяланган, ошондуктан жаңыртуу зарыл болуп көрүндү. Биз жазууну кабыл алганыбызга кубанычтабыз жана LRSтин жана оптикалык геномду картага түшүрүүнүн (OGM) акыркы жетишкендиктерин, ошондой эле алардын чектөөлөрүн, кыйынчылыктарын жана келечек үчүн мүмкүнчүлүктөрүн кеңири чагылдырууну максат кылдык. 

Адамдын сапаттарына таасир этүүчү генетикалык вариациялардын үч негизги түрү бар: кичинекей варианттар (50дөн аз базалык жуптарды камтыган варианттар, ошондой эле бир нуклеотиддик варианттар жана киргизүү/өчүрүү деп да аталат), кыска тандем кайталоолору (кайталануучу экспансиялар RE деп да аталат) жана структуралык варианттар (SV, делециялар, киргизүүлөр, дупликациялар, инверсиялар, транслокациялар). Көптөгөн моногендик бузулуулар дагы эле так молекулярдык диагнозго ээ эмес, негизинен, салттуу секвенирлөө ыкмалары SV жана RE аныктоодо натыйжалуу эмес, анткени экөө тең көптөгөн нейрогенетикалык ооруларда себеп болот. Ошондуктан, бир нече демилгелер нейродегенеративдик оорулардын генетикалык негиздерин чечмелөө үчүн LRS жана/же OGMди колдонууга багытталган. Окурманга LRS жана OGM жетишкендиктерин түшүнүү үчүн биз серепте бир нече комплекстүү мисалдарды келтирдик. Биз LRS бизге белгилүү нейродегенеративдик ооруларда (мисалы, PRKN, SPG4) кыска окуу ырааттуулугу менен аталбаган варианттарды ачууга жана жаңы себептүү гендерди (мисалы, нейрондук ядро ​​ичиндеги кошулуу оорусу жана NOTCH2NLC 5'UTR экспансиясы, Spinocerebellar атаксиясынын 4-тиби жана ZFHX3) ачууга кандайча мүмкүндүк бергенин талкуулайбыз. Ошондой эле, биз LRSтин кайталоонун көлөмүн жана мотивин мүнөздөө жөндөмүн көрсөтөбүз, бул башталуунун жашына, пенетранцияга, тукум куучулукка жана клиникалык фенотиптерге таасир этет (CANVAS жана RFC1, FXTAS жана FMR1, SCA27B жана FGF14). Ошондой эле, биз LRSти колдонуп, варианттарды фазалоо жана гендердеги варианттарды алардын псевдогениндегилерден (GBA1, SORD2) айырмалоо мүмкүнчүлүгүн, ошондой эле жаңы транскрипттерди аныктоо мүмкүнчүлүгүн сүрөттөйбүз. Ошондой эле, биз SV жана REлерди аныктоодо оптикалык геномду картага түшүрүүнүн артыкчылыктарын жана кемчиликтерин баса белгилейбиз. Бул технологиялар азырынча көбүнчө изилдөө шарттарында колдонулуп жатканы менен, келечекте клиникалык лабораторияларда кеңири ишке ашырууну күтөбүз. Бул сереп адистерге алардын пайдалуулугун жана чектөөлөрүн түшүнүүгө жана аларды диагноз коюуда же изилдөөдө акылдуулук менен колдонууга жардам берет деп үмүттөнөбүз!  

макаланы окуп

Бул макала боюнча подкаст маегин угуңуз:

  ук

 

Tweet